Három módszer létezik a CNC szerszámgépek programozására: kézi programozás, automatikus programozás és megmunkáló központ CAD/CAM.
Kézi programozás
A kézi programozás magában foglalja az alkatrészrajzok, feldolgozási technikák kézi elemzését, numerikus számítások végrehajtását, programlisták írását, valamint a program bevitelét és ellenőrzését. Pont{1}}pont-megmunkáláshoz vagy viszonylag egyszerű geometriájú alkatrészekhez alkalmas; az összetett részek programozása azonban nagyon időigényes-és hibákra is hajlamos.
Automatikus programozás
Az automatikus programozás számítógépet vagy programozógépet használ az alkatrészprogram létrehozási folyamatának befejezéséhez, ami nagyon kényelmes összetett alkatrészek esetén.
CAD/CAM
A CAD/CAM szoftver a modellezésen és képeken alapuló automatikus programozás megvalósítására szolgál. A legjellemzőbb szoftver a MasterCAM, amely két-tengelyes, három-tengelyes, négy-tengelyes és öt-tengelyű koordinátarendszerrel, valamint esztergálási és huzalos szikraforgácsolással tud marási műveleteket programozni. Bár az ilyen típusú szoftverek funkcionalitása korlátozott, könnyen megtanulható és viszonylag olcsó.
